Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Best2Q8BGM5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms