Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms