Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms