Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ttc28Q80XJ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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