Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc22a20Q80UJ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a20Q80UJ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms