Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll4Q80UG8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms