Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep170bQ80U49 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep170bQ80U49 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms