Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdh8Q7TSK3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdh8Q7TSK3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms