Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shq1Q7TMX5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms