Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vma21Q78T54 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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