Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms