Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SynmQ70IV5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SynmQ70IV5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SynmQ70IV5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms