Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nup188Q6ZQH8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms