Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms