Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ino80Q6ZPV2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ino80Q6ZPV2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms