Protein–RNA interactions for Protein: Q6YI28

2210407C18Rik, EP1, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210407C18RikQ6YI28 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2210407C18RikQ6YI28 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2210407C18RikQ6YI28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms