Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms