Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Timd4Q6U7R4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms