Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bnip1Q6QD59 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bnip1Q6QD59 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bnip1Q6QD59 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bnip1Q6QD59 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bnip1Q6QD59 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bnip1Q6QD59 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bnip1Q6QD59 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bnip1Q6QD59 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bnip1Q6QD59 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms