Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snrnp40Q6PE01 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrnp40Q6PE01 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms