Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms