Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms