Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrimpolQ6P1E7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrimpolQ6P1E7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms