Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slx4Q6P1D7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms