Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr44Q6NVE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr44Q6NVE8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms