Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo41Q6NS60 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo41Q6NS60 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms