Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcd11Q6NS46 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd11Q6NS46 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms