Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CltbQ6IRU5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CltbQ6IRU5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CltbQ6IRU5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CltbQ6IRU5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms