Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Carmil1Q6EDY6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Carmil1Q6EDY6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Carmil1Q6EDY6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Carmil1Q6EDY6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Carmil1Q6EDY6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Carmil1Q6EDY6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Carmil1Q6EDY6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Carmil1Q6EDY6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms