Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf8Q6DID3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms