Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic2Q62520 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic2Q62520 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms