Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad2Q62432 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad2Q62432 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms