Protein–RNA interactions for Protein: Q62234

Myom1, Myomesin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom1Q62234 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myom1Q62234 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom1Q62234 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom1Q62234 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms