Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssr4Q62186 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ssr4Q62186 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ssr4Q62186 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssr4Q62186 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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