Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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