Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim27Q62158 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim27Q62158 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms