Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctr9Q62018 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctr9Q62018 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctr9Q62018 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms