Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms