Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
JrkQ60976 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JrkQ60976 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms