Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms