Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sin3aQ60520 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sin3aQ60520 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms