Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp20Q5XG71 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp20Q5XG71 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms