Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ssh2Q5SW75 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssh2Q5SW75 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms