Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psme4Q5SSW2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms