Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc85aQ5SP85 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc85aQ5SP85 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms