Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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