Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grhl3Q5FWH3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grhl3Q5FWH3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms