Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Znf608Q56A10 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf608Q56A10 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Znf608Q56A10 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Znf608Q56A10 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms