Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmtc2Q56A06 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmtc2Q56A06 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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