Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prune2Q52KR3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prune2Q52KR3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms